地下水对塔里木河下游生态系统的维持至关重要，生态输水对地下水的补给及影响范围是评估输水成效的关键要素。针对塔里木河下游现状间歇性河道输水中存在补给不均衡、无效蒸发过大、补水范围有限等问题，从空间和时间维度上提出生育期汊河输水、非生育期输水的方式。本文以塔里木河下游英苏监测断面为例，以2012-2021年十次生态输水期间地下水埋深监测数据为依据，运用MODFLOW模型建立英苏断面地下水剖面二维流运动的数值模拟，拟合并分析英苏断面十次间歇性生态输水的响应过程，并在此基础上预测和分析了生育期汊河、非生育期以及非生育期汊河输水的地下水位演变及水量变化的过程。结果表明：（1）生育期汊河、非生育期、非生育期汊河方案下人工汊河两侧地下水位较现状输水分别抬升了2.5 m、0.7 m、3.2 m；（2）三种改进方案较现状输水研究区小于8 m的埋深面积分别增加了10.89 %、19.33%、26.17 %；（3）地下水存储量较现状输水分别增加了10.97 %、11.88 %、14.39 %。非生育期汊河输水结合了两者的优势，提高了下泄水量的利用率，解决了现状主河道输水模式下河间地下水位难以恢复的问题，为河间地块生态系统的恢复并使其成为下游生物多样性的安全带创造了条件。